Agencija za znanost i visoko obrazovanje organizira i provodi stručne poslove pri vrednovanju znanstvene djelatnosti i visokog obrazovanja u RH. Agencija pruža stručnu i administrativnu potporu Nacionalnom vijeću za visoko obrazovanje i Nacionalnom vijeću za znanost te Savjetu za financiranje, ali radi i poslove vezane za priznavanje inozemnih visokoškolskih kvalifikacija.